La temporada 2013-14 comenzó bien, ya que el equipo ocupaba las posiciones nobles en las 10 primeras jornadas. A pesar de ello, el atacante continuó como titular habitual del equipo con un gran apoyo de los aficionados. Pato fue el segundo máximo goleador del equipo por detrás de Kaká, consiguiendo el segundo puesto en la tabla y clasificándose para la Champions League de la siguiente temporada.
