Regresó a la selección en la Copa Mundial de Fútbol de 2006, en la que formó parte del grupo E junto con Ghana, Italia y los Estados Unidos, siendo eliminados tras dos derrotas (2:0 ante Ghana; 2:0 ante Italia) y una victoria (3:0 sobre Estados Unidos), con Pavel Nedvěd de titular y oficiando como capitán en los tres encuentros. Nedvěd recibió el apodo de Furia Checa, por parte de los aficionados italianos, que destacaron su habilidad, consistencia y brío, así como su resistencia, velocidad, equipacion chelsea potencia y determinación.
